Ele reprezintă unirea a doi sau mai mulți aminoacizi printr-o conexiune între original și peptide. În produse și în proteine, aceste legături sunt legate de legăturile peptidice și de rezultatul reacției grupării carboxil, cu gruparea amino a altuia, cu eliminarea unei molecule de apă.
Peptid legătura (-CO-NH-), este de obicei reprezentat ca o singură legătură. Fără totuși, are o serie de caracteristici care se aproximează ca o legătură dublă. Deoarece azotul este mai puțin electronegativ decât oxigenul, legătura CO are 60% caracter dublu legătură, în timp ce legătura CN este 40%. Prin urmare, legăturile CO și NC ale legăturii peptidice au caracteristici intermediare între legătura simplă și legătura dublă. De fapt, distanțele interatomice măsurate în legăturile CO și CN sunt intermediari între legăturile simple și legătura dublă. Acest aranjament atomic este stabilizat prin rezonanță, astfel încât cei șase atomi implicați în formarea legăturii peptidice sunt conținuți în același plan.
O altă consecință importantă a rezonanței este că aceasta mărește polaritatea legăturii peptidice și stabilește un moment dipolar (figura dreaptă din tabelul de mai sus). Din acest motiv, fiecare legătură peptidică poate participa la două legături de hidrogen. Într-una dintre ele, grupa -NH- acționează ca un donator de hidrogen și în cealaltă, grupa -CO- acționează ca un receptor de hidrogen. Această proprietate contribuie semnificativ la plierea tridimensională a proteinelor, așa cum vom vedea mai târziu.
Parțială natura legăturii duble împiedică rotirea liberă a legăturii care unește atomii de C și N, în legătura peptidică. Această rigiditate a dublei legături limitează posibilitățile conformaționale ale peptidelor. Există două configurații posibile:
- Configurare CIS: cele două Ca se află pe aceeași parte a legăturii duble.
- Configurare trans: cele două Ca sunt pe o parte diferită a dublei legături.
Trebuie remarcat faptul că, în general, legătura peptidică este reprezentată ca o legătură simplă. În orice caz, are mai multe caracteristici care îl fac aproape de o legătură dublă. De aceea, specialiștii menționează în general că o legătură peptidică are proprietăți care o plasează la jumătatea distanței dintre o legătură simplă și o legătură dublă.
