Acest termen are concepte diferite, fiecare va depinde de specialitatea științifică unde este aplicat. De exemplu, în biologie, epigenezia este o teorie veche despre mecanismul prin care se dezvoltă ființele umane, adică un embrion evoluează pornind de la zigotul care nu a fost încă distins, ceea ce arată inexistența elementelor miniaturale, a organelor care sunt deja prezente în gamete.
Această teorie contrazice teoria preformării, care afirmă că evoluția unui embrion reprezintă creșterea unui organism care a fost deja preformat. Totuși , conform epigenezei, organele care alcătuiesc embrionul se formează din nimic, prin stimuli derivați din mediu.
Această teorie interpretează mecanismul final de reglare, prin intermediul căruia fiecare ființă este cuplată, într-un mod eficient la mediul său, pornind de la capacitățile incluse în codificarea sa genetică. Deoarece genele fac, în general, parte dintr-o rețea oarecum complicată de interacțiuni care mențin feedback. Prin urmare, ele nu procedează independent.
De-a lungul istoriei a existat întotdeauna o dezbatere care confruntă teoria epigenetică cu preformația. Cu toate acestea, preformationismul ajunge la sfârșit, în același moment în care tehnologia ar putea demonstra originea epigenetică a organelor. Trebuie adăugat că această dezbatere a fost una dintre cele mai istorice văzute vreodată, a avut loc în secolul al XIX-lea.
Acum, în domeniul mineralogiei, termenul de epigeneză este folosit pentru a se referi la modificarea naturii chimice a unui mineral, fără a fi necesară modificarea structurii acestuia.